【無料公開DB】DBRP(生物資源データプラットフォーム)の検索がもっと便利に!
[22/06/27]
提供元:PRTIMES
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新たな機能の実装で検索能力を大幅に強化!
ナイト(独立行政法人製品評価技術基盤機構)が無料公開している、5万株以上の微生物資源とその関連情報(微生物の特性情報、オミックス情報など)を一元的に検索することができるデータプラットフォーム(DBRP)の検索機能を大幅に強化しました。
新たに 絞り込み検索機能 と 同義語検索機能 を実装することでこれまで以上に検索がしやすくなり、検索漏れが大幅に軽減されるようになりました。 パワーアップしたDBRPをぜひ一度ご利用ください。
[画像: https://prtimes.jp/i/92488/50/resize/d92488-50-473354a48db7433f3c14-0.png ]
DBRPとは?
NBRCでは2019年6月からDBRP(Data and Biological Resource Platform:生物資源データプラットフォーム)を無料公開しています。 DBRPは、5万株以上の微生物資源とその関連情報(微生物の特性情報、オミックス情報など)を一元的に検索することができるデータプラットフォームです。
NBRCが保有する生物資源に対して蓄積された豊富なデータに加えて、物質生産や薬剤耐性などの特性情報や文献情報、およびゲノムなどのオミックス情報といった様々な情報を関連するデータベースから収集し生物資源にひもづけて、一元化しています。 これにより、生物資源に関する様々な情報をまとめて検索することができ、効率的な情報収集が可能です。
●登録データの日本語化を推進しており、「乳酸菌」などの一般的なキーワードで検索できます。採取地(国名、地名)、分離源(食品由来など)からの検索や、データの種類(ゲノム情報、画像情報など)を選択しての検索もできます。
●様々な機関の生物資源とその情報の登録機能を有しています。企業、大学、公的機関などからの生物資源情報の登録を受け付けております。
〇 DBRPトップページ(検索画面):https://www.nite.go.jp/nbrc/dbrp/top
〇 DBRP解説ページ:https://www.nite.go.jp/nbrc/dbrp/about/
リニューアルしたポイントとDBRPの使い方を解説する動画(YouTube)
[動画1: https://www.youtube.com/watch?v=Tq4xV6NDL_I ]
強化したポイント!
強化ポイント1. 〜絞り込み検索〜
微生物株のリストに対し、分離源や酸素要求性、属名など複数のプルダウンメニューでの絞り込みができるようになりました。 もちろんこれまでのようにコレクションやゲノムデータの件数などでソートし絞り込むこともできます。
強化ポイント2. 〜同義語検索〜
DBRPに同義語辞書※を搭載いたしました。 これまでは「収録データ全文検索」で「ワイン」を検索するとカタカナの「ワイン」の記載のあるデータのみが検索結果として表示されていましたが、今回の強化により「wine」の検索結果も併せて表示されるようになりました。 これにより、表記の違いによる検索漏れが大幅に軽減され、検索の幅が格段に向上しました。
※同義語辞書は、ライフサイエンス辞書プロジェクト(http://www.life-science-dictionary.com)で得られた研究成果を利用しています。
皆様のご意見をお待ちしております
今回の機能強化に留まらず、今後も搭載する機能やデータの更新を継続することでユーザーの皆様の利便性向上に努めてまいります。ユーザーの皆様のご意見を積極的に取り入れ、ユーザーフレンドリーなサイト構築を目指します。 新しいDBRPに対するご意見、ご要望をお待ちしております。
ご連絡先
独立行政法人 製品評価技術基盤機構(NITE)
バイオテクノロジーセンター(NBRC)
バイオデジタル推進課
お問い合わせの際は以下のフォームにてお気軽にご連絡ください。
https://www.nite.go.jp/cgi-bin/contact/?cid=00000146&lang=0
独立行政法人製品評価技術基盤機構(NITE)バイオテクノロジーセンター(NBRC)
独立行政法人製品評価技術基盤機構(NITE)バイオテクノロジーセンター(NBRC)は、9万株の微生物を中心とした生物資源及びそれらにかかわるデータの提供を行っています。
国内外の多様な微生物を収集・保存するとともに、有用微生物の活用技術や安全・取り扱い情報等を広く社会に提供することで、バイオ産業の発展に貢献しています。
[動画2: https://www.youtube.com/watch?v=rttCwdYR4hk ]
『秘密結社 鷹の爪』とのコラボレーションにより、NBRCの業務を紹介する動画を作成しました。 ぜひご覧ください。
[動画3: https://www.youtube.com/watch?v=dXnOHqeCBsM ]
ナイト(独立行政法人製品評価技術基盤機構)が無料公開している、5万株以上の微生物資源とその関連情報(微生物の特性情報、オミックス情報など)を一元的に検索することができるデータプラットフォーム(DBRP)の検索機能を大幅に強化しました。
新たに 絞り込み検索機能 と 同義語検索機能 を実装することでこれまで以上に検索がしやすくなり、検索漏れが大幅に軽減されるようになりました。 パワーアップしたDBRPをぜひ一度ご利用ください。
[画像: https://prtimes.jp/i/92488/50/resize/d92488-50-473354a48db7433f3c14-0.png ]
DBRPとは?
NBRCでは2019年6月からDBRP(Data and Biological Resource Platform:生物資源データプラットフォーム)を無料公開しています。 DBRPは、5万株以上の微生物資源とその関連情報(微生物の特性情報、オミックス情報など)を一元的に検索することができるデータプラットフォームです。
NBRCが保有する生物資源に対して蓄積された豊富なデータに加えて、物質生産や薬剤耐性などの特性情報や文献情報、およびゲノムなどのオミックス情報といった様々な情報を関連するデータベースから収集し生物資源にひもづけて、一元化しています。 これにより、生物資源に関する様々な情報をまとめて検索することができ、効率的な情報収集が可能です。
●登録データの日本語化を推進しており、「乳酸菌」などの一般的なキーワードで検索できます。採取地(国名、地名)、分離源(食品由来など)からの検索や、データの種類(ゲノム情報、画像情報など)を選択しての検索もできます。
●様々な機関の生物資源とその情報の登録機能を有しています。企業、大学、公的機関などからの生物資源情報の登録を受け付けております。
〇 DBRPトップページ(検索画面):https://www.nite.go.jp/nbrc/dbrp/top
〇 DBRP解説ページ:https://www.nite.go.jp/nbrc/dbrp/about/
リニューアルしたポイントとDBRPの使い方を解説する動画(YouTube)
[動画1: https://www.youtube.com/watch?v=Tq4xV6NDL_I ]
強化したポイント!
強化ポイント1. 〜絞り込み検索〜
微生物株のリストに対し、分離源や酸素要求性、属名など複数のプルダウンメニューでの絞り込みができるようになりました。 もちろんこれまでのようにコレクションやゲノムデータの件数などでソートし絞り込むこともできます。
強化ポイント2. 〜同義語検索〜
DBRPに同義語辞書※を搭載いたしました。 これまでは「収録データ全文検索」で「ワイン」を検索するとカタカナの「ワイン」の記載のあるデータのみが検索結果として表示されていましたが、今回の強化により「wine」の検索結果も併せて表示されるようになりました。 これにより、表記の違いによる検索漏れが大幅に軽減され、検索の幅が格段に向上しました。
※同義語辞書は、ライフサイエンス辞書プロジェクト(http://www.life-science-dictionary.com)で得られた研究成果を利用しています。
皆様のご意見をお待ちしております
今回の機能強化に留まらず、今後も搭載する機能やデータの更新を継続することでユーザーの皆様の利便性向上に努めてまいります。ユーザーの皆様のご意見を積極的に取り入れ、ユーザーフレンドリーなサイト構築を目指します。 新しいDBRPに対するご意見、ご要望をお待ちしております。
ご連絡先
独立行政法人 製品評価技術基盤機構(NITE)
バイオテクノロジーセンター(NBRC)
バイオデジタル推進課
お問い合わせの際は以下のフォームにてお気軽にご連絡ください。
https://www.nite.go.jp/cgi-bin/contact/?cid=00000146&lang=0
独立行政法人製品評価技術基盤機構(NITE)バイオテクノロジーセンター(NBRC)
独立行政法人製品評価技術基盤機構(NITE)バイオテクノロジーセンター(NBRC)は、9万株の微生物を中心とした生物資源及びそれらにかかわるデータの提供を行っています。
国内外の多様な微生物を収集・保存するとともに、有用微生物の活用技術や安全・取り扱い情報等を広く社会に提供することで、バイオ産業の発展に貢献しています。
[動画2: https://www.youtube.com/watch?v=rttCwdYR4hk ]
『秘密結社 鷹の爪』とのコラボレーションにより、NBRCの業務を紹介する動画を作成しました。 ぜひご覧ください。
[動画3: https://www.youtube.com/watch?v=dXnOHqeCBsM ]